疯狂动物园中动物的稀有度划分为四个明确等级：普通、稀有、史诗和传说。这种分级直接决定了动物的获取难度与技能强度，稀有度越高则驯服条件越苛刻，但对应的能力加成也越显著。游戏通过栖息地升级、任务触发、隐藏条件等多种机制实现稀有动物的投放，其中传说级动物往往需要完成特定连续操作或参与限时活动才能解锁。
稀有动物的出现概率与栖息地等级密切相关，将栖息地升至9级是解锁顶级稀有动物的基础条件。部分特殊动物如异形虎需在山脉地图找到普通老虎后，连续攻击30只不同动物才能触发生成；而极地区域的仙女企鹅则要求玩家连续换乘8种不同动物（7种极地动物+1种外来动物）。这类设计体现了游戏对玩家操作连贯性和地图熟悉度的双重考验。
隐藏任务和随机事件是获取史诗动物的主要途径。当动物健壮度维持100%时，地图角落可能刷新发光快递箱，开启后可获得限量动物图纸；特定天气条件下也会激活专属抓捕场景。社交玩法同样影响稀有度获取，每日赠送好友体力有概率获得幸运券，集齐20张可兑换蓝鲸等特殊动物，联盟捐献成就则能解锁远古巨蜥等孵化任务。
时间机制在稀有度系统中扮演重要角色。每日凌晨3点、9点、15点的系统刷新时段，动物碎片合成成功率会阶段性提升；夏时制与标准时交替期间，合成概率额外增加37%。限时活动如联合国日期间提交5种异国动物可解锁白虎，这类设计需要玩家合理规划资源与时间投入。部分传说动物存在严格的失败惩罚机制，操作失误会导致抓捕进度重置。
